Een traject bij een gezinstherapeut volgt meestal een gestructureerd verloop. Tijdens de intake worden de hulpvragen van alle aanwezigen in kaart gebracht. Daarna volgt de anamnese, waarbij de familiegeschiedenis en onderlinge relaties worden besproken. Tijdens de behandelsessies werkt de therapeut met gespreksvormen of opdrachten om interacties positief te veranderen. Elke sessie eindigt met een korte evaluatie of adviezen en oefeningen voor thuis, zodat de gemaakte stappen direct in de dagelijkse praktijk worden gebracht.